Fondato nel 1350 dal Sovrano Militare Ordine di Malta come Commenda di San Giovanni di Monopoli nel centro storico in largo San Giovanni con omonima chiesa.

Nel 1790 fu costruito uno stabile a due piani, tuttora esistente, ed adibito ad Ospedale al tempo del Commendatore Fra' Erberto Mirelli dei Principi di Teora, come si può dedurre dalla lapide murata sulla porta d'ingresso